Po wrześniowej klęsce chciał przedzierać się do Francji, by służyć w odtwarzanym tam regularnym Wojsku Polskim. Powstrzymał go gen. Michał Tokarzewski-Karaszewicz, twórca Służby Zwycięstwu Polski (SZP), przekonując, że nie może zabraknąć wartościowych ludzi w kraju. Rowecki pod pseudonimem Stefan Grabica objął w SZP funkcję szefa sztabu.