Niemiecki Kościół katolicki swe finanse zawdzięcza wpływom z tzw. podatku kościelnego, co daje w sumie ok. 450 mld euro rocznie. 150 mln trafia do NKB, które z tej sumy pokrywa działalność m.in. Sekretariatu Episkopatu z siedzibą w Bonn i koszty pracy Katolickiego Biura Konferencji Biskupów, mieszczącego się w Berlinie.

Pokaźną część swego budżetu Episkopat przeznacza również na finansowanie pracy niemieckich misjonarzy w różnych krajach świata. Konferencja Biskupów dotuje media katolickie, które mają znaczenie ogólnokrajowe.

Wśród nich na pierwszym miejscu jest Katolicka Agencja Prasowa (KNA), którą w 40 proc. utrzymuje Episkopat, a resztę wpływów uzyskuje ze sprzedaży swych usług. Duże wsparcie finansowe otrzymuje też ogólnokrajowy tygodnik katolicki „Rheinischer Merkur”, jak również kilka innych mniejszych inicjatyw i projektów, realizowanych przez katolickie środki przekazu, np. katolicka szkoła dla dziennikarzy w Monachium.