Trudno powiedzieć, kiedy w krakowskiej bazylice Mariackiej po raz pierwszy rozległ się głos królewskiego instrumentu. Nie daje odpowiedzi na to pytanie najstarsza zachowana piszczałka, pochodzi ona bowiem dopiero z 1800 roku, a – jak wiadomo – parafia mariacka powstała 800 lat temu, pierwsza zaś zachowana wzmianka o organach rozbrzmiewających w murach mieszczańskiej fary pochodzi z 1399 roku. Na pewno ich gra zabrzmiała w świątyni w 1489 roku, podczas konsekracji ołtarza Wita Stwosza. Jak donoszą kroniki, słuchał ich wówczas król Kazimierz Jagiellończyk, choć instrument wykonany przez organmistrza Jana Niedzielę nie był jeszcze wtedy oficjalnie oddany do użytku.