Pierwszą potwierdzoną próbką, w której ujawniono szczep koronawirusa nazwany później omikron, była próbka pobrana w połowie listopada w Botswanie. Kilka dni później był już w RPA. Po kolejnych dwóch dniach Międzynarodowa Organizacja Zdrowia zaliczyła tę odmianę wirusa do grupy wariantów wymagających uwagi. Dzisiaj omikron jest już w Europie, a w niektórych państwach Afryki jest szczepem dominującym.