Przeciw zakazowi budowy minaretów opowiedziały się m.in. szwajcarski rząd i Kościół katolicki. Podkreślano, że taki zakaz to naruszenie wolności religijnej. Sekretarz generalny episkopatu ks. Felix Gmür zauważył, że w trakcie kampanii przed referendum mówiono nie tyle o kwestiach religijnych, ile o zagrożeniu terroryzmem.

Jego zdaniem, przezwyciężenie lęków możliwe jest na drodze współpracy różnych wyznań. Przykładem tego jest Bazylea, gdzie jest największy w Szwajcarii odsetek muzułmanów. Właśnie tam społeczeństwo odrzuciło zakaz budowy minaretów.

O skutki, jakie podjęta decyzja będzie miała dla chrześcijan w Arabii, obawia się tamtejszy ordynariusz, pochodzący ze Szwajcarii bp Paul Hinder.